MALDI Biotyper를 이용한 동정 실험은 미생물 동정 분석에서 비용을 절약 할 수 있는 방법으로, 기존 automated phenotype 동정법에 비하여 약 1.85배 절감 할 수 있으며, 본 실험을 수행한 실험실을 기준으로 하였을 때에는 매년 EUR 98,906 (한화 약 1억3천 만원)를 절약 할 수 있다. 하루에 19 ~ 27개의 isolate (연간 5,000 ~ 7,000개) 이상의 isolates를 분석 하게 되면 기존 방법대비 비용을 절약 할 수 있다. MALDI Biotyper를 이용한 미생물 동정은 높은 성능에 의한 높은 동정률로 빠르고 정확하게 분석이 가능하며 시간 비용 감소에 매우 효과적이다. 프랑스의 한 병원에서 MALDI Biotyper를 구입 후 1년간 동정비용을 기존 방법과 비교하였을 때 기존 phenotype 동정법에 비하여 1년간 실제 한화 약 2억 정도의 비용 절감 효과를 발표하였다. 기존 자동화된 phenotype 분석법은 6~ 18시간의 동정 시간이 소모되는데 반해 MALDI Biotyper는 isolates를 곧바로 분석하여 수 분내에 동정이 가능하다. 기기 분석에 소요되는 시간까지 고려해보면 Biotyper는 매우 고효율의 장비이며 경제적인 미생물 동정 장치이다.