MALDI-TOF 질량 분석기는 미생물 동정 실험에 꾸준히 증가되고 있는 경향을 보이고 있다. Figure 1에서 전세계에 분포하고 있는 MALDI Biotyper Site의 수를 나타내었다. MALDI-TOF를 이용한 종 수준의 미생물 동정은 빠르고 정확하며 신뢰성이 있고 경비 절감 측면에서 큰 장점을 가진다. 본 실험에서는 MALDI-TOF를 이용한 동정 실험과 자동화된 phenotype 분석법을 이용한 미생물 동정 실험에 사용되는 시약 및 재료 비용과 시간 비용을 측정하여 비교 분석 하였다.

Figure 1. Global MALDI Biotyper site on May 2014

본 연구를 진행하는 실험실은 하루에 약 68개의 isolate를 분석하며 260일 정도의 working day를 잡으면 연간 18,000개의 isolate를 분석하게 된다. 본 실험에서는 MALDI-TOF를 이용한 미생물 동정과 기존의 자동화된 phenotype 분석법의 비용을 비교하였다. 미생물의 종별, 사용 기간별로 비용 절약 정도를 추정하였다. 비용은 시약 및 재료 비용과 시간 비용을 비교하였으며 시간비용은 실험자가 직접 실험에 수행하는 시간으로만 측정하였으며 분당 약 EUR 1.2로 계산하였다.

총 1,337개의 여러 미생물 isolates가 실험을 수행하는데 사용이 되었으며 총 1,337개의 isolates를 분석하는데 드는 비용은 MALDI-TOF를 이용한 방법이 기존의 phenotypic automated system에 비하여 2.36배 더 저렴하게 사용이 되었다.
각 미생물의 종마다 동정 비용은 큰 차이가 있었다. Figure 2 는 각 미생물의 종류별로 기존 방법 대비 MALDI-TOF의 비용절감 비율을 나타내었다. 예를 들어 Eschericia coli의 최소 동정 비용은 기존 방법과 MALDI-TOF 방법에서 각각 EUR 2.29, EUR 1.75가 소모 되었다. 평균적인 E.coli (n=255)의 동정비용은 기존방법과 MALDI-TOF방법 각각 ERU 5.41, EUR 3.08로 MALDI-TOF이용시 1.75배 정도 감소하는 것을 알 수 있다. 또한 Staphylococcus aureus (n=277), Pseudomonas aeruginosa (n=104) 그리고 Enterococcus faecalis (n=80)는각각 1.8, 2.07 그리고 5.05배의 비용 절감 효과를 보였다.

Figure 2. Relative cost reduction according to the identified species, expressed as the ratio of traditional identification costs
by MALDI-TOF costs