Objective: 동정이 어려운 임상 시료에서 기존 phenotypic method와 MALDI-TOF MS의 동정 능력을 비교함과 동시에 VITEK MS, Bruker Biotyper MS의 각 MALDI-TOF MS에서의 미생물 동정 능력을 비교하였다.
	Method: Barnes-Jewish Hospital로부터 174개의 bacterial isolates를 제공받아 미생물 동정 비교실험을 진행하였으며 16s rRNA gene sequencing을 이용하여 검증을 하였다.
	Result: Phenotypic method에 비하여 MALDI-TOF MS를 이용한 실험에서 더욱 높은 동정률을 나타내었으며 Bruker Biotyper MS가 총 161개, VITEK MS가 151개의 bacteria isolates를 식별하였다. 간혹 동정이 어려운 시료에서 phenotypic method는 50일 이상이 걸렸으나 MALDI-TOF MS를 이용한 실험에서는 48 시간 이내에 동정을 완료 하였다.
	Conclusion: MALDI-TOF MS를 이용한 미생물 동정 방법은 기존 phenotypic method에 비하여 더욱 정확하고 빠른 방법이며 각 Bruker Biotyper MS, VITEK MS의 미생물 동정방법의 비교에서 Biotyper MS가 더 높은 동정율을 나타내었다.

MALDI-TOF MS를 이용한 미생물동정이 최근 트렌드로 많이 사용이 되고 있음에도 불구하고 아직까지 미생물동정은 phenotypic method가 주를 이루고 있는 실정이다. Phenotypic method의 경우 아직까지 일반적인 미생물동정에 유용하게 사용되고 있지만 임상실험실에서 발생하는 특이하고 어려운 organism의 경우에는 식별이 힘들며 분석 시간 또한 오래 걸린다. 또한 궁극적으로 16S rRNA gene sequencing의 방법을 통한 검증이 필요로 하여 시간이 오래 걸리게 된다. 이러한 한계점을 극복하기 위하여 최근에는 MALDI-TOF MS를 이용한 미생물 동정법이 많이 사용되어 지고 있으며 많은 paper를 통하여 MALDI-TOF MS를 이용한 미생물동정은 사용방법이 쉽고 매우 빠르고 정확하며 경제적인 방법임이 확립되었다.

본 실험의 목적은 실제 동정이 어려운 임상 시료에서 MALDI-TOF MS의 미생물 동정능력을 평가하기 위함과 동시에 기존 phenotypic method와 MALDI-TOF MS의 동정 능력 비교 및 VITEK MS, Bruker Biotyper MS의 각 MALDI-TOF MS에서의 미생물 동정 능력을 비교하기 위하는 것을 목적으로 하였다.

	본 연구는 Barnes-Jewish Hospital로부터 174개의 식별이 힘든 bacterial isolates를 제공받아 실험을 진행하였다(table 1).
	대부분의 bacteria의 경우 5 % sheep blood agar에서 overnight 배양 하였으며 간혹 잘 자라지 않은 박테리아의 경우는 48시간 배양을 하였고, cell culture가 까다로운 박테리아는 chocolate agar를 통하여 배양하였다.
	각 isolates는 VITEK MS와 Bruker Biotyper MS를 이용하여 동정을 진행하였다. 모두 2번의 실험을 진행하였으며 처음 실험은 직접도말법을 이용하였고, 두번째는 formic acid를 첨가하여 동정을 실시하였다. 동정이 되지 않은 isolates에 대해서 따로 단백질 추출법으로 실험 하지 않았다.
	본 실험의 동정 결과는 16S rRNA gene sequencing 방법을 이용하여 비교 검증하였다.

Table 1. Organisms tested in this study