트랜스 지방산은 인간에게 매우 부정적인 영향을 끼친다. US 식품의약품안전청 (US FDA)은 트랜스 지방의 섭취는 관상동맥 심장질환의 위험을 증가시키는 LDL 콜레스테롤 수치를 높인다고 발표하였다. FDA는 식품 제조사들이 식품 내의 트랜스 지방 함량을 알리는 것으로 1년에 약 1,200가지의 심장 질환과 500명의 사망을 예방할 수 있을 것이라고 추정하였다.

트랜스 지방은 경화유(Hydrogenated Oil)의 형태로 다양한 식품 속에 존재하고 있으며, 이러한 경화유의 사용은 다양한 식품들, 특히 구운 식품들의 밀도를 높여주고 유통기한을 늘려주기 때문에 광범위하게 사용되고 있다.

덴마크, 미국, 캐나다에서 시작하여 세계 여러 나라에서 식품 제조사들이 트랜스 지방산의 함량을 Figure1에서 보는 것과 같이 식품의 포장용기에 기입하도록 엄격한 가이드라인을 제정하였다. 이러한 식품내용 표시 라벨의 중요성으로 인하여 트랜스 지방 함량을 분석하는 데에도 엄격한 요건들이 따르게 되었다.

American Oil Chemist Society (AOCS)나 Association of Official Analytical Chemists (AOAC)에서 인증한 트랜스 지방의 분석방법은 적외선 분광기(IR)와 가스 크로마토그래피(GC)를 사용하는 것이다.

GC 장비는 이용이 용이하고 이것의 감도 때문에 일반적으로 많이 사용된다. GC Method (AOCS Ce 1f-96 & AOAC 996.06)는 함량을 0.5%까지 분석해 낼 수 있지만, GC로의 주입을 위해서 중성지방(Triglycerides)이 지방산을 얻기 위해 쪼개져야만 하고, 지방산은 지방산 메틸에스테르 (FAME, Fatty Acid Methyl esters)로 전환되어야 한다. 게다가 cis와 trans 피크가 겹침으로써 지방함량이 잘못 측정될 수 있으며, cis와 trans 이성질체를 분별해 내기 위해서는 TLC나 HPLC를 사용해야만 한다. 그러므로 많은 시간과 노력이 필요하다.

Figure2의 Trielaidin (100% trans)와 Triolein (100% cis)에 대한 스펙트럼에서 보듯이, FT-IR 스펙트럼에서는 cis와 trans에 대한 피크가 서로 다른 위치에서 나타난다. 전통적인 적외선 분광법(Cd 14-95)은 지방산 메틸에스테르(FAME)와 희석용매로써 Carbon Disulfide (CS₂)를 사용하여 측정하였다. 하지만 이는 매우 번거롭고 감도가 제한적일 수 있으며, CS₂의 사용은 이것은 냄새 때문에 불쾌할 수 있다. 이 Method는 0.5%까지 분석해 낼 수 있다고 명시하고 있지만, trans 피크는 큰 피크 내에 shoulder 형태로 나타나므로 약 5%까지의 농도 밖에 측정하지 못한다.

더욱 새로운 적외선 분광법은 Heated horizontal ATR 액세서리를 사용하는 것이며, 이는 AOCS Cd14d-99와 AOAC 200.10에 명시되어 있다. ATR Method는 쉽고 빠르게 사용할 수 있으며 재현성이 뛰어나다. ATR을 사용한 지방 샘플 내의 Trans 이성질체의 분석은 지방산 메틸에스테르(FAME)로의 전환 등의 샘플 전처리를 하지 않고, 냄새 나는 용매를 사용하지 않고도 가능하다. Single-bounce ATR은 약 50마이크로리터 또는 그 이하의 샘플량을 필요로 한다.

ATR 방법에서 요구되는 한가지는 Cd14-95 Method에서 보여주는 Shoulder Peak 측정과 일정한 베이스라인을 얻어내기 위해 trans-free 지방을 Background로 측정하여야 하며, 이 Method는 trans 함량을 1%까지 측정할 수 있다. 그러나, trans-free 지방은 지방 샘플의 지방산 프로필과 거의 비슷해야만 하며, 만약 그렇지 않으면 정량분석의 정확성이 떨어질 수 있다. 이는 유저가 측정하고자 하는 지방 샘플과 매우 비슷한 trans-free 지방을 Reference로 선택해야만 한다는 것을 의미한다.