(Figure 3)과 (Figure 4)는 Yeast Sample을 가지고 1D-LC/MS/MS와 MudPIT를 적용한 2D-LC/MS/MS로 각각 실험한 데이터로서, 하나의 RP Column 만 사용하는 1-D LC-MS/MS(Figure 3)에서는 Gradient를 걸어주는 시간을 달리하며 분석되는 Protein 수를 확인하였다. 아울러 2D-LC/MS/MS(Figure 4)에서는 하나의 SCX Column과 두개의 RP Column을 사용하여 140분 정도 Gradient를 걸어주면서 동시에 Salt의 농도를 달리한 4단계의 Salt Steps을 주어 분석되는 Protein 수를 확인하여 같은 시간 대비 분석되는 Protein 수를 (Table 1)에서 비교하여 보았다.               (Table 1)에서 볼 수 있듯이 1D-LC/MS/MS 보다는 MudPIT를 적용한 2D-LC/MS/MS에서 분석되는 Protein 수는 약 5배 이상 많은 것을 확인할 수 있었다. 최근의 프로테오믹스에서 LC-ESI/MS/MS는 단백질을 확인하는데 필수적으로 요구되는 핵심기술로 자리잡고 있으며, 나아가 단백질체를 보다 빠르고 수작업 없이 자동으로 정확하게 분석할 수 있는 MudPIT 등의 기술은 이미 국내외에서 주목 받고 있다.