Biotyper는 microflex, The New autoflex speed등 bruker사의 모든 MALDI-TOF에 사용가능 한 소프트웨어이며 MALDI-TOF와 함께 Biotyper 소프트웨어를 사용하면 미생물을 colony에서부터 수분 내로 정확한 동정이 가능하다.

기존 생물학적 미생물 동정법은 일반적으로 phenotype을 이용한 동정법으로 비교적 정확하지 않은 결과를 가질 수 있으며 소요시간이 길고 노동 집약적인 실험 이다.

자동화된 phenotype test 방법이 개발 되었지만 이 방법 또한 짧게는 8시간에서 16시간의 분석시간이 필요하다.

이에 반해 미생물 동정의 새로운 패러다임을 여는 Biotyper는 자란 colony를 즉시 MALDI TOF에 적용하여 실시간으로 얻은 m/z의 패턴과 방대하게 구축된 미생물 라이브러리를 이용하여 수 분내로 결과를 도출 하므로 보다 정밀하고 초고속 동정을 가능하게 하는 소프트웨어이다.