High Sensitive Linear Ion Trap Spectrometer 이온포집질량분석기 (Ion Trap Mass Spectrometer)는 또다른 방식의 MS/MS Spectrometer로서 이온화된 목적물질을 일정한 공간안에 포집하고 불활성 충돌시켜 발생되는 고유의 딸이온을 선택적으로 검출하는 장비이다. 앞서 언급하였듯이 Ion Trap의 작동 원리는 기본적으로 Triple Stage Quadrupole과 비슷한데, MS/MS 효율 및 여러이온의 동시검출 감도가 Triple Stage Quadrupole에 비해 비교적 우수한 반면 한가지 물질에 대한 정량성이 다소 떨어진다는 장단점을 가진다. 이번에 선보인 Finnigan의 LTQ는 기존의 삼차원 Ion Trap 보다 포집효율과 포집량을 대폭 증가시킨 선형 Hyperbolic Ion Trap을 채용하여 감도, 검출속도, 정량성을 동시에 높인 새로운 Ion Trap Mass Spectrometer이다. (그림 4) 또한 필요시에는 FT-ICR Mass Spectrometer와 결합시킨 LTQ-FT로의 업그레이드가 가능하여 현존하는 LC/MS/MS 중 최고사양의 장비라고 할 수 있다. 국내외에서 그 우수성이 입증된 Finnigan LCQ Ion Trap을 근간으로 진보된 기술이 집적된 LTQ는 보다 정교해진 이온화 기술로 용매제거를 최적화시킨 새로운 이온화원(Ion Max Source)이 장착되었으며, 두개의 전자증폭 검출기를 탑재하여 기존 장비들에 비해 10배 이상의 감도향상을 구현하고 있다. 또한 사용자가 필요로하는 모든 기능을 자동구현 함으로써 사용이 쉽고 안정하게 설계된 것이 장점으로 부각된다. 특히 특정영역에서의 고분해능 기능인 Ultra ZoonScan을 이용하여 목적이온의 전하상태를 정확하게 알고 동위원소 분석이 가능하며 나아가 분자량의 확인도 보다 용이하게 되었다. (그림 5) 아울러 초당 4회 이상의 빠른 Scan Cycle 및 완전하게 자동화된 MS/MS 기능등을 통해 크로마토그래피에서 미처 분리되지 못한 복잡한 시료에 대해서도 검출이 가능하고 이는 Proteomics 및 Metabolomics 연구에 큰 기여를 할것으로 보인다. 한편 기존의 삼차원 Ion Trap Analyzer의 약점으로 지적되었던 정량성에 있어서, LTQ가 Triple Stage Quadrupole과 버금가는 직선성과 표준편차를 지닌 것이 주목할 만하다. (그림 6)